Turecko označilo zásah izraelskej armády proti novej flotile ako "akt pirátstva". Turecké ministerstvo zahraničných vecí vyhlásilo, že izraelské sily zadržali tureckých poslancov, ako aj občanov Francúzska a Talianska, ktorí sa zúčastnili na tejto flotile. Turecká vláda ostro odsúdila tento zásah a vyzvala na okamžité prepustenie zadržaných osôb.
Podľa tureckých úradov flotila smerovala do Gazy s cieľom poskytnúť humanitárnu pomoc a vyjadriť solidaritu s obyvateľmi tohto regiónu. Izrael však obhajuje svoj zásah ako nevyhnutný krok na ochranu svojich hraníc a zabránenie prísunu zbraní do Gazy. Turecko sa snaží mobilizovať medzinárodnú komunitu, aby reagovala na tento incident a vyvinula tlak na Izrael.
Tento konflikt medzi Tureckom a Izraelom sa opäť dostáva do popredia, pričom obidve krajiny majú dlhodobé napäté vzťahy, najmä v súvislosti s otázkami Palestíny a humanitárnych kríz v regióne. Turecké ministerstvo zahraničných vecí varovalo, že Izrael nesie zodpovednosť za následky tohto "pirátstva" a vyzvalo na medzinárodné vyšetrenie incidentu.