V posledných rokoch čelí vláda regiónu Madrid vážnym problémom s financovaním verejných univerzít. Po rokoch nedostatočnej podpory sa teraz musí vyrovnať s deficitmi, ktoré dosahujú milióny eur. Napríklad, Universidad Complutense de Madrid (UCM) požiadala o 35 miliónov eur na pokrytie mzdových nákladov, zatiaľ čo Universidad Rey Juan Carlos (URJC) sa nachádza v podobnej situácii. Madrid je jediným regiónom v Španielsku, ktorý znížil investície na študenta od roku 2008.
Podľa odborníkov na univerzitné financie, ak sa situácia nezmení, môže to viesť k ročnému deficitu 200 miliónov eur pre šesť madridských univerzít. Vláda pod vedením Isabel Díaz Ayuso obviňuje univerzity z nadmerného počtu zamestnancov a navrhuje, aby sa univerzity snažili získať financie z privátneho sektora. Tento prístup však vyvoláva obavy o zachovanie verejného charakteru vzdelávania.
URJC je najhoršie financovanou univerzitou v krajine, pričom na študenta dostáva len 4 291 eur, čo je menej ako polovica priemeru. Oproti tomu Universidad Politécnica de Cartagena, ktorá je najlepšie financovaná, dostáva trojnásobok tejto sumy. Opozičné strany kritizujú vládu za zanedbávanie univerzít a žiadajú plán na zabezpečenie ich udržateľnosti.
V súčasnosti sa situácia zhoršuje, keďže vláda znižuje príspevky, zatiaľ čo náklady na mzdy rastú. Odborníci varujú, že ak sa nezmení model financovania, môže to mať dlhodobé negatívne dopady na kvalitu vzdelávania v regióne.